Копия черепа яванского человека, обнаруженного в Сангиране, Центральная Ява.

Доисторический период Индонезии охватывает время с появления первых гоминид и до первых буддийских королевств, возникших около 200г. дон.э.

Первые гоминиды

В период плейстоцена территория западных островов современной Индонезии (ныне Зондский шельф) длительное время была соединена с азиатским материком, поскольку уровень моря в эпоху последнего ледникового максимума был намного ниже современного. Индонезийский архипелаг образовался в результате оттепели по окончании последнего оледенения.

Окаменевшие останки разновидности Homo erectus , известные в популярной литературе как « яванский человек », свидетельствуют, что первые гоминиды появились в Индонезии в период 1млн.— 500 тыс. лет назад .

Средний палеолит

Несколько лет назад на острове Флорес были открыты костные останки, получившие название « флоресский человек » ( Homo floresiensis ). Это был миниатюрный гоминид высотой не более метра  . До настоящего времени остаётся открытым вопрос, является ли флоресский человек отдельным видом  , или просто карликовым вариантом яванского человека, с которым он сосуществовал, пока оба не исчезли около 10000 лет назад. Флоресский человек мог изготавливать достаточно сложные орудия труда. Он не был предком современного человека.

 Верхний палеолит

Homo sapiens прибыл в Юго-Восточную Азию около 45000 лет назад  . Вероятно, на территории Индонезии он какое-то время сосуществовал с флоресским человеком . Первоначально Индонезию заселяли носители австралоидной расы , однако около 2000г. дон.э. они были поглощены более многочисленными монголоидными племенами— носителями австронезийских языков . Австралоидное население— папуасы — сохранилось лишь на территории Западного Ириана , который до недавнего времени развивался в культурном отрыве от индонезийского архипелага.

Бронзовый век

Носители австронезийских языков составляют подавляющее большинство современного населения Индонезии. Вероятно, они прибыли на архипелаг с Индокитая около 2000г. дон.э  . Культура Донг-Шон пришла в Индонезию из Индокитая и принесла с собой обряды и технологии заливных полей , ритуальных погребений буйвола, литья бронзы, мегалитических погребений, а также методами изготовления иката — традиционной индонезийской ткани. Некоторые из этих практик сохранились почти в неизменном виде в ряде регионов Индонезии, в том числе среди батаков на Суматре, тораджей на Сулавеси, и на нескольких из Малых Зондских островов . Ранние австронезийцы были анимистами , почитавшими духов умерших, которые якобы присутствовали незримо в мире живых.

Идеальные условия для ведения сельского хозяйства и освоение технологии заливных полей не позднее 8 в. дон.э  . содействовали возникновению деревень и городов. Возникают небольшие царства, расцвет которых приходится на 1 в. дон.э. Эти царства-вождества (зачастую представлявшие собой не более чем союз нескольких деревень) развивались, сохраняя собственные племенные религии.

Жаркая и равномерная температура Явы, обильные дожди и богатая вулканическим пеплом почва содействовали культивации риса. Интенсивное сельское хозяйство, основанное на заливных полях, требовало хорошей социальной организации в отличие от тех регионов, где использовался сухой (не заливной) метод культивации злаков.